福建省儿童医院是我省卫生健康领域开工建设民生补短板项目的重中之重，列入《福建省“十三五”卫生计生事业发展专项规划》，纳入省政府立项挂牌办理内容。医院将建成为集医疗、预防、保健、康复、科研、教学于一体，引入一站式医疗体验、全时间生理监护、网络化远程医院、数字化手术中心、自动化物流系统等智慧服务设计理念，符合国家儿童区域医疗中心设置标准的大型专业的儿童医院。
医院占地233亩，建筑面积22.7万平方米，设置床位1000张，计划配备人才1820余人，下设27个临床科室、11个医技科室及9个研究部门。医院将建成以儿童心脏医学中心、新生儿重症医学、儿童外科群、新生儿外科学、儿童神经医学、儿童呼吸中心、儿童肾病学、儿童重症医学为专科重点特色的综合性、国内一流的儿童医学中心。2020年12月25日，福建省儿童医院正式开诊。
2020年8月21日，福建省人民政府与上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心签署合作共建协议，委托上海儿童医学中心管理福建省儿童医院，建设上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心福建中心。
舒适就诊环境
医院各建筑单体通过医疗主街相联，由南往北设有南病房楼、医技楼、北病房楼和科研行政医学中心，医疗街往东设有门诊楼和配套用房及教学交流中心，鸟瞰建筑的外轮廓近似半个圆环，构建出“虚圆实方”的整体建筑造型。设计方案荣获2017年中国医院建设匠心奖年度优秀项目。
门诊区域每个诊室均直接采光通风，候诊区设置儿童活动区、阅览区等设施。南北病房楼共12个标准病区，7个净化病区，病房设计温馨明亮，营造舒适的住院环境。
高端仪器设备
医疗设备配置从作为区域儿童医学中心的定位出发，配备医用直线加速器系统、PET/CT、高端CT、3.0T磁共振成像系统、1.5T磁共振成像系统、ECT/CT、滑轨CT、复合手术床、C型臂、全自动生化免疫流水线、3D腹腔镜、腹腔镜手术荧光导航系统等医疗设备。
智慧医院管理
构建新一代智能化患者服务平台——”医院外联智慧微服务平台”，从诊疗预约、智能导医、费用支付、患者管理、患者反馈、标识导航、安全管理等全方位服务患者。配备数字化手术室、数字化内镜中心系统、医疗物联网无线输液监控系统、智能电子药品/耗材管理、医用轨道物流小车系统、手术室辅助服务机器人系统、数字医院综合管理平台等，实现智慧医院管理。
